氣相色譜儀固定相的填充辦法有加壓填充法、減壓填充法和手動填充法等。

一、加壓填充法：

將填充柱的一端塞好硅烷化玻璃棉，另一端與填料池聯接。先將固定相倒入填料池，填料池的另一端出口與氮氣或空氣鋼瓶的減壓閥連接。關于內徑4.5 mm的填充柱，可調節氣流為30ml/min，將填充池內的固定相壓入填充柱中，一起用木棒輕敲填充柱體，使固定相填充均勻。固定相填充結束后，在原本聯接填充池的一端塞上硅烷化的玻璃棉，留心這一端應該與色譜儀的進樣室聯接，另一端作為出口端與檢測器連接，不能接反。

二、減壓填充法：

填充長柱子時多選用此法。選用真空泵抽氣，將填充柱的一端塞好硅烷化的玻璃棉后與真空泵的緩沖安全瓶連接。為了避免抽氣時濕潤空氣進入而使固定相性能受影響，填料池參加固定相后，在入氣口接氯化鈣和硅膠干燥塔。其它操作過程與加壓填充法相同。

三、手動填充法：

一般只用于某些涂有沸點較低固定液的固定相填充。選用邊裝邊敲打的辦法，每次加進柱內的填料約5cm。

填充時應留心：一是固定相要填充均勻和適度緊密，柱內不留有死空間或許空隙；二是要避免填充過程中敲打振動過猛，形成固定相機械損壞。