影響色譜柱使用壽命的主要因素如下：
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　　1、色譜柱破損

　　石英毛細管柱的聚酰亞胺層，如有少許破損就很嫩再保護脆弱的石英毛細管。當柱箱連續加熱和冷卻、柱箱風扇的振動和柱架等都會對毛細管造成應力，zui終在色譜柱有弱點處破裂。
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　　2、熱損傷

　　超過色譜柱溫度上限，會造成色譜柱固定相和管表面加速損壞，色譜柱的過量流失會使活性組分拖尾，降低柱效。一般熱損壞是一個很慢的過程，但有氧存在時，會大大加速熱損壞。
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　　3、氧損傷

　　氧是毛細管柱的大敵，在接近室溫下，不會對色譜柱有太大損害，柱溫升高時會嚴重損壞色譜柱。
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　　4、化學損傷

　　有少數化合物會使固定相遭到破壞，不揮發性化合物進入色譜柱常常會降低色譜柱的性能，但是不會破壞固定相，有條件時這些沉積的殘留物可以用溶劑沖洗，能恢復色譜柱的性能。
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　　5、污染

　　氣相色譜中，毛細管柱被污染是很普遍的問題，不幸的是，它和各種各樣常見的故障想死，常常被錯誤地判斷為其它的故障，雖然被污染了的色譜柱并沒有損壞，但是已經失去了效能。

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